به دنبال نمایه شدن تعدادی از مجموعه مجلات علمی منتشره توسط دانشگاه علوم پزشکی تبریز در (Emerging Sources Citation Index (ESCI ، در حال حاضر مقالات این مجلات در پایگاه معتبر(Web of Science (ISI قابل جستجو و بازیابی است.
بر پایه بررسی دفتر نشر معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه در ماه ژوئن 2016، مقالات شماره‌های اخیر مجلات Advanced Pharmaceutical Bulletin ، BioImpacts و Journal of Cardiovascular and Thoracic Research از مجموعه مجلات علمی منتشره توسط دانشگاه علوم پزشکی تبریز در Web of Science بازیابی می‌گردد.
دانشگاه علوم پزشکی تبریز در حال حاضر 12 مجله علمی-پژوهشی منتشر می‌کند که در پایگاه‌های معتبر ایرانی و بین‌المللی نمایه می‌گردد.